1.国家自然基金面上项目,31671369,基于质谱技术高通量的完整信息糖蛋白/糖肽的鉴定新方法研究,2017.01~2020.12,主持
2.国家自然基金面上项目,31270834,基于质谱词典思想的谱库设计及理论谱预测研 究,2013/01-2016/12, 主持
3.北京市自然科学基金面上项目, 5102029,基于高性能计算及重核技术的蛋白质质 谱比对服务器建设,2010/01~2012/12,主持
4.国家自然基金青年科学基金项目,30800189,磷酸化肽质谱鉴定中的算法问题研究 ,2008/01-2010/12,主持